José Gutiérrez, o “Pepe”, como lo conocían sus amigos y colegas, estudió en la escuela tradicional Gimnasio Moderno de Bogotá, de la cual se graduó en 1944. Luego estudió medicina en la Universidad Nacional de Colombia ( Universidad Nacional de Colombia), graduándose en 1950. Tuvo su primera experiencia en psiquiatría durante sus dos años en París (1948-1950). Posteriormente, continuó estudios en psiquiatría y completó su formación psicoanalítica en México (1955-1961). Gutiérrez se casó con Magdalena Restrepo Ortega, psicóloga de la Universidad Nacional de Colombia (1954); tuvieron tres hijos: Marcela (1955), Alberto (1957) y Francisco (1958).
