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Molecular detection and genotyping of intestinal protozoa from different biogeographical regions of Colombia Artículo académico uri icon

Abstracto

  • Antecedentes: Los protozoos parasitarios intestinales representan un grave problema de salud pública, especialmente en los países en desarrollo. Protozoos como Blastocystis, Giardia intestinalis, Entamoeba histolytica y Cryptosporidium spp. están asociados con síntomas diarreicos. En Colombia, existen pocos datos específicos de la región sobre la frecuencia y los genotipos/especies circulantes de estos microorganismos. Por lo tanto, el objetivo principal de nuestro estudio fue emplear la detección y genotipificación molecular de G. intestinalis y Blastocystis, Cryptosporidium y Entamoeba spp. en muestras de diferentes regiones biogeográficas de Colombia. Métodos: Se recolectaron 649 muestras fecales humanas de cinco regiones biogeográficas de Colombia: Amazonas, Andina, Caribe, Orinoquía y Pacífico. Se detectaron Blastocystis, G. intestinalis, Cryptosporidium spp. y el complejo Entamoeba mediante microscopía y PCR convencional. Se realizó la genotipificación molecular para identificar los subtipos de Blastocystis (ST) (18s), los conjuntos de G. intestinalis (triosa fosfato isomerasa y glutamato deshidrogenasa) y las especies de Cryptosporidium (18s). Los índices de diversidad genética se determinaron mediante dnasp.5. Resultados: Se detectó G. intestinalis en el 45,4% (n = 280) de las muestras, Blastocystis en el 54,5% (n = 336) de las muestras, Cryptosporidium spp. en el 7,3% (n = 45) de las muestras, Entamoeba dispar en el 1,5% (n = 9) de las muestras y Entamoeba moshkovskii en el 0,32% (n = 2) de las muestras. Se identificaron los STs 1-4, 8 y 9 de Blastocystis y los conjuntos AII, BIII, BIV, D y G de G. intestinalis. Se identificaron las siguientes especies de Cryptosporidium: C. hominis, C. parvum, C. bovis, C. andersoni, C. muris, C. ubiquitum y C. felis. La región del Caribe presentó la mayor frecuencia para cada uno de los microorganismos evaluados (91,9% para G. duodenalis, 97,3% para Blastocystis, 10,8% para Cryptosporidium spp., 13,5% para E. dispar y 2,7% para E. moshkovskii). La región del Orinoco tuvo una alta frecuencia de Blastocystis (97,2%) y la región andina tuvo una alta frecuencia de G. intestinalis (69,4%). Se evidenció una transmisión alta y activa en varias regiones del país, lo que implica que se deben mejorar los mecanismos de prevención y control de las parasitosis intestinales en diferentes zonas del país.
  • Background: Intestinal parasitic protozoa represent a serious problem of public health particularly in developing countries. Protozoa such as Blastocystis, Giardia intestinalis, Entamoeba histolytica and Cryptosporidium spp. are associated with diarrheal symptoms. In Colombia, there is little region-specific data on the frequency and circulating genotypes/species of these microorganisms. Therefore, the main objective of our study was to employ molecular detection and genotyping of G. intestinalis and Blastocystis, Cryptosporidium and Entamoeba spp. in samples from different biogeographical regions of Colombia. Methods: We collected 649 human fecal samples from five biogeographical regions of Colombia: the Amazon, Andean, Caribbean, Orinoco and Pacific regions. Blastocystis, G. intestinalis, Cryptosporidium spp. and Entamoeba complex were detected by microscopy and conventional PCR. Molecular genotyping was conducted to identify Blastocystis subtypes (STs) (18s), G. intestinalis assemblages (triose phosphate isomerase and glutamate dehydrogenase) and Cryptosporidium species (18s). Genetic diversity indices were determined using dnasp.5. Results: We detected G. intestinalis in 45.4% (n = 280) of samples, Blastocystis in 54.5% (n = 336) of samples, Cryptosporidium spp. in 7.3% (n = 45) of samples, Entamoeba dispar in 1.5% (n = 9) of samples, and Entamoeba moshkovskii in 0.32% (n = 2) of samples. Blastocystis STs 1-4, 8 and 9 and G. intestinalis assemblages AII, BIII, BIV, D and G were identified. The following Cryptosporidium species were identified: C. hominis, C. parvum, C. bovis, C. andersoni, C. muris, C. ubiquitum and C. felis. The Caribbean region had the highest frequency for each of the microorganisms evaluated (91.9% for G. duodenalis, 97.3% for Blastocystis, 10.8% for Cryptosporidium spp., 13.5% for E. dispar and 2.7% for E. moshkovskii). The Orinoco region had a high frequency of Blastocystis (97.2%) and the Andean region had a high frequency of G. intestinalis (69.4%). High and active transmission was apparent in several regions of the country, implying that mechanisms for prevention and control of intestinal parasitosis in different parts of the country must be improved.

fecha de publicación

  • 2020-3-9